中国渔业船舶磨练局是直属于国家农业部的正局级机构，下设办公室、财政处、系统建设与信息处、法例监视处、磨练治理处、商品质量监视处、手艺进展处等机构，主要负担凭据国家相关执法法例和国家接受认可的国际条约要求，以及2008年国务院办公厅印发农业部“三定”方案划定“农业部推行的渔业船舶磨练和监视治理职责。
中国渔业船舶磨练局的详细职责是贯彻执行国家有关渔业船舶磨练的执法法例，推行有关国际条约的有关义务；起草渔业船舶磨练的执法法例、渔业船舶及船用商品磨练计费尺度；起草渔业船舶法定磨练规则，经农业部批准后组织实行；制订渔业船舶磨练规范、规程、证书花样及指示性文件并监视实行；卖力渔业船舶和船用商品法定磨练及监视治理；处置渔业船舶磨练中的重大手艺问题、营业纠纷；组织协调有关国家和地区 托付的渔业船舶磨练营业；组织、协调、指示渔船公证磨练营业；卖力渔业船舶磨练机构磨练营业审定；负担渔业船舶注册验船师制度实行的相关事情；监视渔业船舶磨练机构营业执行情形；监视验船职员依法磨练与文明执法；卖力渔业船舶的设计单元、修造企业及主要船用商品制造、维修企业、检测机构的认定和监视治理；负担渔业船舶船用锅炉压力容器的平安监察治理；指示渔业船舶修造企业特别工种职员的培训、审核事情；制定渔业船舶必需磨练的主要装备、部件和质料目录，经农业部批准后组织实行；负担全中国渔船尺度的制、修订事情；负担全中国渔船渔机渔具产业的指示事情。