广西凭祥总合保税区是我国第四个获得国务院批准设立的总合保税区，也是中国第一个在陆地疆域线上设立的总合保税区，以周全服务中国－东盟自由商业区，加速推进广西北部湾经济区建设为责任，充实施展陆路口岸优势，努力加入东盟市场甚至西方市场的工业分工，建设成为国际商业繁荣、进口和出口加工蓬勃、总合物流功效完善的开放条理最高、政策最优惠、功效最齐全完善的边检 特别羁系区域；使用外资的主要区域和特别渠道；形成中国――东盟自由商业区各成员国之间以及与全球各国开展国际商业、保税物流集散以及加工商业的主要基地。
广西凭祥总合保税区作为广西北部湾经济区开铺开发的主要平台，以及服务于中国――东盟自由商业区商业往来，集口岸、国际商业、保税物流、保税加工、国际配送等功效于一体的国际经济互助区域，享受海内货物入区视同出口马上退税、境外入区商品施行保税、区内企业建设所需物品免关税和入口环节税、境外货物入出区免允许证和出口配额、区内企业运往境外或在区内销售的商品免加工环节增值税，区内企业间货物生意业务免征增值税和生意业务税，宽松的外汇治理等特别政策。