深圳电子口岸是广东省深圳地域物流通关信息服务的同一公共信息平台，也是中国电子口岸在地方上的延伸，拥有公共舱单数据服务系统、大铲湾港口（1期）物流通关信息系统、深圳港区出口运抵陈述系统、盐田保税物流园区信息系统、前海湾保税港区信息系统、边检 内网监控平台，主要负担为深圳市政府有关部门及企业提供周全的物流通关数据传输服务，以及应用服务和大通关“一站式”服务等主要职义务务。
深圳电子口岸施行同一网络接入，同一身份认证；口岸电子执法；物流通关数据交流及应用服务；物流信息通关服务；物流电子商务等模式，修建联接政府与政府、政府与企业、企业与企业的同一公共信息平台，以深圳周边的进口和出口加工企业、物流企业和口岸企业为主要服务工具，提供物流通关的相关服务。