珠江航务管理局是中华人民共和国交通运输部在珠江水系的派出机构，主要负责珠江水系的航运管理。下设办公室、人事部、计划财务部、政策法规部、计划部(水系办)、交通管理部、航道工程管理部、信息部、党群工作部(纪检监察部)、行政事务中心、广西办、云贵办、珠江航道杂志等机构。珠江航政管理局的次要职能是就珠江水系航运进行战略讨论，组织编制和修订水系航运发展规划和水系二级港口总体规划。开展协调水资源综合利用的任务；作为珠江水系航运转移管理机构，履行珠江区域内河省级运输企业审批职责；担任珠江水系干路运输市场的管理、省际运输协调、停车行业管理；协助交通部实施、协调、监测和管理珠江水系项目。承担珠江系统科技信息交流任务，协助交通部制定水运技术规范、技术政策和科技发展规划。